Creado por acuerdo del Consejo Universitario el 17 de agosto de 2007, el CEPHCIS tiene como misión consolidar e impulsar, en y desde la Península de Yucatán, la investigación, la formación de recursos humanos y la extensión académica en los campos propios de las Humanidades y las Ciencias Sociales —y desde ellos la interdisciplina con otros ámbitos del quehacer científico—, y contribuir de ese modo en el fortalecimiento de la vocación nacional de la Máxima Casa de Estudios de nuestro país.